一六三三年，沙贾汗击败并兼并了艾哈迈德讷格尔王国。然而，这次胜利却激起几股力量的反抗，这些力量将加速莫卧儿帝国的灭亡。沙贾汗于一六三八年重新占领坎大哈，但于一六四九年再次失去了它。在一次徒劳无功地攻占撒马尔罕的尝试中，他损失了五千人。他只在南方取得了胜利，在那里，他首先追击一位因被怀疑叛国而于一六二九年逃到艾哈迈德讷格尔王国的将军。沙贾汗在布尔汉布尔指挥军事行动。
一六五七年，沙贾汗病重，他的四个儿子开始争夺皇位。沙贾汗宠爱他的长子达拉·什克，但他的第三子奥朗则布在诸王子中最有能力，他和达拉·什克特别仇视对方。沙贾汗恢复了健康，但那时他的儿子们之间的冲突已经到了没有回头路的地步，因此他无法阻止家族内部的战争。一六五八年，奥朗则宣布获胜，废黜了他的父亲。
十七世纪中期，莫卧儿帝国处在黄金时代。印度人本是杰出的建筑师，皇帝沙贾汗时期，印度建成了德里的红堡等许多著名建筑。在这众多的名胜古迹中，最著名的是沙贾汗为其死去的宠妃建造的礼物——阿格拉市的泰姬陵。
奥朗则布是莫卧儿帝国最重要但也最具争议的皇帝。他放弃了莫卧儿帝国初期尤其是阿克巴时代的宗教宽容政策，加强***教的宗教地位，企图使印度完全***化。奥朗则宣布恢复对非穆斯林征收人头税，将印度教徒逐出政府，并大举拆毁印度教庙宇与神像。这些短视的政策导致帝国境内的非穆斯林与政府的矛盾突然尖锐起来，并很快演变成武装斗争。坚持自己信仰的锡克教徒和拉其普特人成为莫卧儿帝国公开的敌人；奥朗则布虽然多次打败他们，却无法彻底消灭其反抗力量。最危险的国内敌人是新兴的马拉塔人国家，它后来发展出可与莫卧儿帝国匹敌的军事能力。
另一方面，由于奥朗布力图消灭他的政治对手，莫卧儿帝国的疆域在他在位时扩张到最大限度。他长期驻留在德干指挥对该地区各穆斯林小国的征服，这些国家是十六世纪初德干的***教强国巴赫马尼王朝分裂后形成的。其结果是奥朗布取得了胜利，将德干地区并入帝国版图，成为印度南方的最高统治者。除了南亚次大陆的南端和马拉塔王国以外，奥朗则布统一了整个印度次大陆。奥朗则布去世后的莫卧儿帝国称为“后期莫卧儿”。这一时期的特点是，皇帝大都昏庸无能，马拉塔人愈战愈强，大有取莫卧儿而代之的趋势。但是，决定印度命运的因素是新生的欧洲列强。
李啸选择的进攻时间正好是阿克巴去世后，莫卧儿帝国先后由贾汉吉尔和沙贾汗统治这个时期。正是贾汗吉国王时期，锡克教第五代祖师阿尔琼把教区改为行政机构，向信徒征收赋税。这一举动在莫卧儿帝国内引起震动，它显然具有分庭抗礼的意味。阿尔琼还在阿姆利则建立金店，作为锡克教圣地和行政管理中心机关，由于此时莫卧尔帝国因收税造成内战，在南方少年军和北方闻香教军团进攻，打得莫卧尔帝国措手不及，两方进展非常顺利，攻城夺寨，占领城池四十多座，莫卧尔帝国也在开始反攻。
少年军第一次遇见莫卧儿帝国的正规军，军队由四大部分组成：轻步兵+战象+炮兵+骑兵，如果少年军不是用的自动武器，投弹筒，步兵炮，火箭炮，火箭筒这些先进武器，见到战象兵也会心虚，可已经沾血的少年军，战力之强悍，就是遇见女真铁骑，也绝对有胜无败。
在大明军队入侵的强大压力下，因收锐分裂的莫卧儿帝国各大势力团结起来，共同对抗明军。
此时明军攻击明显也出了问题，进攻太快，兵力开始分散起来，造成兵力空虚，李啸知道需要放慢进攻速度，增加兵力，对占领区进行管理和巩固，由战略进攻转为战略防守，原准备一年攻下莫卧尔帝国，转为用两年时间攻下莫卧尔帝国，消化一个大国不是一件简单事。
李笑命令徐忠部加快速度占领陕西，打土豪，分田地，吃官粮，编炼部队，调往天竺防守已占领的地盘，天竺的粮食，资产无数，养军队没有任何问题，用天竺的粮食解决大明的天灾，正好是一个有效方案，把榆林的铁路往天竺修，将军队往天竺送，把天竺的粮食往大明运非常有必要，对陕西，山西，河北，河南的流民往陕西转移，整编后往天竺送，将天竺人往大明送来当矿工，建筑工，农奴，进行民族融合，再进攻大明城池不再杀官，让这些人去天竺教圣人之道，教汉语，进行汉化。