贞观六月已卯，皇帝、承乾、李泰、李治等儿女的陪伴下长孙皇后在立政殿安然闭上了双眼，走完了他波澜壮阔的一生，时年三十六岁。承乾知晓皇后对自己的满意，自承乾来到这里以来连带着对承乾身边服侍之人也赏赐多责罚少，自从承乾到来后更是极少见皇后责罚儿子，更多是母子齐乐融融的时光，承乾不止令皇帝满意，也令满朝上下赞誉有加，乃至对皇帝看不惯的大臣也只是说“逮竹出了好笋”罢了。
紧接着又是在一边紧张筹备丧葬事宜一边百官公卿吵架的半年中度过。和太上皇薨逝时皇帝的泰然处之相比，这时的皇帝明显是悲伤难掩，皇帝的旧疾发作了，李唐皇室的遗传头风也在此时发作，皇帝从六月开始就高低烧和旧疾头风一齐发作，皇帝这次将政务悉数交给了承乾和朝中公卿们，本该是权利欲加重的时候但对承乾而言却更向如履薄冰的煎熬，承乾生怕自己的到来改变了历史导致一些不可预测的事情发生，承乾更怕皇帝此时一命呜呼令承乾抓狂，承乾还未来得及做准备，实在不知该如何是好，只得一面和东宫僚属和公卿大臣们处理朝政事务，一面侍奉于皇帝榻前，祈求皇帝不要英年早逝这么快走。太子妃苏氏则同样忙碌，不仅要负责照顾李治等幼弟幼妹，还要负责帮助皇帝打理后宫，还要在朝廷有司协助下分理长孙皇后的丧葬事宜，忙的分身乏术，太子妃和太子承乾的每次会面都有许多事务协商，也都有一堆人跟随左右，甚至连私事也不得说。
这年冬十一月庚寅葬文德皇后于昭陵，这时承乾才发觉困扰自己已久的原主留下的肥硕身材终于算是消下去了，太子妃也清瘦了许多，夫妻二人刚刚培养出的感情也消散的差不多，还有更令承乾忧心的，皇帝依旧未能彻底康复，不过承乾还是交还了政务，承乾也很累，被人时刻监护的掌握权柄的皇太子和不受束缚的皇帝终究差距不小。十二月壬申，吐谷浑政局转向平稳，河源郡王慕容诺曷钵终于抽出时间来朝觐见，皇帝和太子等人皆参与接见，盛宴款待。乙亥，皇帝亲录京师囚徒，大赦天下。而关内、河东瘟疫再次袭来，朝廷特命太医暑派遣医师、医正、医工等四十余名医官带着朝廷赉药前往救治。
大唐的医署大体分作两座机构，一是太医署，是大唐医疗卫生的最高机构，主要负责管理医疗卫生行政事务、培养医学人才、发布医疗政策，主要成员是医学官员，医生也有三百多名，但是诊疗对象非常多，包括普通官员、军队、官府工匠、各类宫廷和官府供养人员，所以在京的医生数量也就四五十人而已，况且他们品级并不高，大都是**品。太医署有严格的等级区分，并没有任何一个医生可以被叫做太医，一般朝廷说太医说的便是太医暑，太医署内医生又可分为医师、医正、医工等，一般称呼太医署医师应当是太医署医师某某，给内宫宫女内监看病主要是内侍省一个叫患坊的地方，那里有病床，有太医署医师。
而另外一个机构是殿中省尚医局。他们主要给帝后、皇子、皇孙、后妃、大僚等提供医疗服务。尚医局主要成员不再是官而是医生，品级最高的是正五品的尚医局奉御，一共有两位，专门为帝后和太子皇帝宠妃等为数不多的几人看病，他们同时也是大唐官位最高的医生。这二位奉御配有四名助手，名叫直长。除了这四位直长，还有诸如值守、烧火的药童、负责制药的主药，负责抓药、管理药材的掌固，还有负责按摩的按摩师，负责祛除邪咒的咒禁师等等。尚药局主要负责给后妃宫嫔、皇子皇孙、大寮看病的主要是四名司医和八名医佐。每次给皇子皇孙后妃等人看病都有人传召，然后拿好鱼符、契书等验明身份的物件，然后在殿中省内监和宫城卫兵等人的护卫下前往内宫问诊。一般还会有女医，她们出生官府奴婢，会一些安胎、产子、唑疮、伤折、针灸等方面的治疗方法。