普萨美提克五世仅仅在位5年，就被内法阿鲁德一世刺杀，内法阿鲁德一世随后建立古埃及第二十九王朝。第二十九王朝也很短命，唯一值得一提的就是，它曾经与斯巴达结盟，共同对抗波斯帝国。
公元前380年，军人出身的内克塔内布一世夺取了埃及政权，建立了古埃及第三十王朝。这个朝代的埃及，才正式出现了标准化的铸币。第三十王朝也仅仅统治了埃及37年的时间，在此期间，波斯人不断地向埃及发起进攻，但是都被埃及联合希腊人一一打回去了。公元前343年，波斯帝王阿尔塔薛西斯三世几乎收买了所有的希腊城市，并且成功策反了英勇善战的希腊士兵成为波斯雇佣军。面对强大的敌人，这次埃及军队地抵抗显得苍白无力，埃及再度被波斯人攻陷。
愤怒的阿尔塔薛西斯三世下令波斯士兵摧毁埃及神庙，大肆破坏标志性建筑以及烧毁相关的埃及宗教文献，埃及文明遭受了毁灭性的打击。波斯人甚至极大地提高了埃及地区的赋税，让整个埃及人民持续地生活在水深火热之中。生活的温饱问题都不能解决，是没有资格谈论精神的，而且往后的10年里，留守埃及的波斯驻军一直都在忠实地执行摧毁埃及文明的任务，也就是从这个时候起，埃及文明开始出现断层。
历史把波斯的第二次统治称为古埃及的第三十一王朝。亚历山大来到埃及驱逐波斯人后，埃及人民是毫无抵抗地欢迎希腊人的统治的。亚历山大最终也是加冕为埃及法老，建立了希腊化的第三十二王朝。埃及文明与希腊文明开始互相融合，现今埃及的第二大城市城市亚历山大港就是当年希腊猛男留下来的历史痕迹。比较可惜的就是世界“八大奇迹”之一的亚历山大灯塔在1303、1332年两次地震中不幸受损沉入海底。
亚历山大突然暴毙后，原亚历山大的马其顿帝国在埃及地区的总督托勒密自立为王，建立了古埃及第三十三王朝（托勒密王朝）。托勒密王朝与继承波斯地区的塞琉古王朝为了争夺地中海与爱琴海的霸权，前前后后打了六次叙利亚战争，把双方打得是筋疲力尽。
托勒密王朝最后一位君王叫克利奥帕特拉七世，她就是大名鼎鼎的古埃及最后一任法老，我们习惯称她为埃及艳后。埃及艳后为了保住埃及，先是主动成为了凯撒大帝的情人，凯撒被暗杀后，埃及艳后又主动交好凯撒的手下安东尼，并且与安东尼领证结婚生小孩，埃及艳后活生生地为埃及续命了22年，最后安东尼被屋大维打败，安东尼和埃及艳后双双死去，埃及最终还是没能逃脱成为罗马帝国的一个省份的命运。
到了阿拉伯帝国崛起，埃及继续沉沦，成为了阿拉伯帝国的另外一个省份，并且开始了漫长地伊SI兰化，古埃及文明只能在记忆中去寻找了。