《太平经》还反映出当时道教的神的另一个特点，就是“物”与“神”是相互依存的关系，也就是形而上的东西和形而下的东西之间建立了一种联系，从而导致了形而上的神就有了善恶之分。正是这种神和社会之间的投影，就把神学理论同社会政治联系上了，这也就是为什么甘忠可会入狱，于吉会被杀，黄巾军会起义，五斗米道开创了政教合一的先河的根本原因。
不知大家是否注意到了，这里我讲于的神学理论，也提到了葛洪的神仙体系，这在早期道教中也是有原因的。当时，或者说在以于吉为代表的人们心中，神和仙是不同的。早在战国时期就出现“仙”的概念，比如《庄子》里提到的著名的藐姑射之山的仙人，《列子》里讲的归墟里的仙人等。在《太平经》中，于吉认为的仙和神是不同的，人可以成仙，成仙后再继续努力，追求进步，才有机会成神。也就是说，仙是介于人和神之间的，能够长生不死，会飞，还会各种变化的人。仙人们还不能完全超脱，去过自由自在的生活，还要上班的，具体做什么工作呢？比如掌管四时变化、行云布雨等等吧，这些思想和战国时期不同，那时的仙和神还没有明确区分。
记得玄幻小说刚流行那段时期，有些作者构建的小说脉络中，人可以通过修真而成仙，仙再继续修炼后再成神，神也能继续修炼，然后又成……，这个不说了，有兴趣的可以找几本看看。这些作者不知道是借鉴了于吉的神仙理论，还是因为脑洞足够，要是于吉把《太平经》写得通俗一点，可以当成玄幻小说来看了。
接着探讨于吉的神学理论。在汉末那样黑暗的社会大环境下，无论怎么工作、怎么累，仙人还是有着先天的让凡人羡慕、渴望的优势和资本，毫无疑问，人人都愿意当仙人。那么怎么才能加入到仙人大家庭中呢？后世道教就有了一系列的修炼的法门，而在早期，这些还没有被开发出来。于是，于吉就说了，想成仙吗？可以，去“学道积德”吧。他的成仙办法很原始，就是让大家都要多多得做好事，好好学习，天天向上，然后就能成为贤人；成了贤人以后，继续好好学习，天天向上，进而就能成为圣人；圣人再接着学习，就会成道、成仙、成真、成神。您看，于吉打造的升级模式，比现在小说的升级流一点都不逊色。大家想到没有，于吉的这种思想，其实还是有出于政治目的考虑，宣扬的人人做好人好事，从本质上还是为了统治阶级服务的。
除了神和仙以外，于吉还提出了鬼这个物种的存在。
于吉说每个人都有灵魂的，只有身体和灵魂合一才是活人，否则就会死亡。更进一步，《太平经》中还提出了人是生活在天地中的，同时天地也存在于人身体里的，神是生活在天上的，同时人身体里同样有神的存在，这就是道教早期的“心神合一”理论。
实际上，于吉的这种“心神合一”的理论，是在吸取了西周时期就有的天命论和西汉董仲舒的“天人之际，合而为一”的理论而发展出来的。在此理论上，于吉又说，人的灵魂如果离开了身体就成了鬼，这时人当然也就死了。当然，于吉并不是早期的研究生命学的科学家，他构想出来的鬼，也是一种宗教思维。于吉不是希望人们积德成仙嘛，那要是有人不想成仙，天天想当坏人怎么办呢？这时候就轮到鬼这个东西出场了。如果天上的神发现你在做坏人，不好好修仙，他就会命令鬼去惩罚你，具体怎么惩罚的方法那就多了，反正都是你不希望遇到的，诸如让你做噩梦、让你鬼打墙、让你鬼剃头等等吧。当然，鬼这个东西大家都看不到，那么他平时生活在哪里呢？答案是黄泉和土府，这是鬼应该去的地方。于是，就有了我们现在的神话里的黄泉地府了。当然，鬼在早期道教中是反面角色，常常是祸害人的，为后世的道教的神仙理论体系中早早定下了基调。