赤壁之战后，刘备与周瑜等人率军水陆并进，一路追击曹军至南郡。曹操无力再战，只得率军退回北方，留下曹仁、徐晃驻守江陵，派乐进镇守襄阳。
此时，甘宁在夷陵被曹仁军队包围，形势危急。周瑜采纳吕蒙的计策，留下凌统率军在正面抵御曹仁，自己亲率一半兵力，火速驰援甘宁，最终大破敌军，胜利而还。同年，孙权也亲自率领大军围攻合肥，同时派张昭攻打九江郡当涂县。张昭出兵不利，未能取胜；孙权围攻合肥，也久攻不下，最终只得率军撤退。
建安十四年（209年），周瑜与曹仁在江陵一带相持已长达一年多。曹仁军孤军无援，死伤众多，无力再守，最终弃城退走。孙权拿下南郡之后，正式任命周瑜为南郡太守，镇守荆州重地。同年，刘备上表朝廷，奏请封孙权代理车骑将军，兼任徐州牧，孙刘联盟进入一段相对和睦的时期。
此后，孙权与刘备在京口相见，两人会晤甚欢，为巩固联盟，孙权同意将南郡等地借给刘备，让刘备有了立足之地。这次会面，进一步巩固了孙刘联盟，使曹操一时之间难以南下。
在此期间，周瑜曾秘密向孙权进言，建议将刘备软禁在吴地，然后趁机调离关羽、张飞，分化瓦解刘备集团，逐步吞并其势力。但孙权认为，曹操在北方虎视眈眈，正应当广纳英雄，又担心刘备难以轻易控制，反而惹火烧身，因此没有采纳。吕范也在刘备拜见孙权之时，秘密建议扣留刘备，孙权同样出于大局考虑，没有听从。
曹操在北方听闻孙权将荆州之地借与刘备，震惊不已，正在写信的他，手中之笔都不觉落在地上。
为了防范孙权南下，曹操后来下令强制迁徙淮南一带的民众，向内迁移。这一举措，反而引发江淮地区十余万户百姓惊慌不安，百姓不愿北迁，纷纷渡过长江，归附孙权，使得江东人口与实力大增。
建安十五年（210年），孙权将目光投向南方广袤的交州，派遣交州刺史步骘率军南征。大军压境之下，交州九郡望风臣服，纷纷归顺江东。交趾太守士燮，率领众兄弟接受孙氏管制，成为江东藩属。只有刘表当年任命的苍梧太守吴巨，表面臣服，暗中违抗，最终被步骘设计斩杀。孙权为了笼络士燮一族，稳定交州，特加封士燮为左将军，加以重用。自此，交州之地，尽归江东。
建安十六年（211年），孙权听从谋臣张纮的建议，认为秣陵山川形胜，有帝王之气，于是将治所迁至秣陵，开始营建新都。
建安十七年（212年），孙权下令修筑石头城，加固城防，并将秣陵正式改名为建业，也就是今天的南京，从此，南京正式登上历史舞台，成为江东的政治中心与军事重镇。同年，为防备曹操南下进攻江淮，孙权又下令修筑濡须坞，建立坚固的水上要塞，扼守长江北岸要道。
建安十八年（213年）正月，曹操果然率领大军攻打濡须坞，企图一举突破江东防线。孙权亲自坐镇指挥，以水军围攻曹操的陆军，大败曹军，俘获三千余人，曹军溺水而亡者也有数千人之多。两军相持一个多月，曹操见孙权军容严整，水军精锐，难以攻克，最终不得不率军撤退。
建安十九年（214年）五月，孙权再次率军北上，亲率吕蒙、甘宁等猛将，征讨皖城。此战进展神速，一举攻破城池，俘获庐江太守朱光、参军董和，以及男女百姓数万口。经此一战，孙权彻底控制了江淮南部地区，江东的北部防线，也由此变得更加稳固。
至此，孙权历经十余年苦心经营，内平叛乱，外拓疆土，北拒曹操，西联刘备，南收交州，成为三分天下之中，举足轻重的一方雄主。